BSA-seq（Bulk Segregant Analysis sequencing）是一种基于群体遗传学的基因定位方法，它结合了传统的 Bulk Segregant Analysis（BSA）策略与高通量测序技术，用于快速定位影响特定性状的基因或基因区段。这种方法通常用于植物和动物的遗传改良研究，特别是在农作物育种和家畜改良中。 BSA-seq的核心原理是基于混合群体的表型分离来定位影响特定性状的基因。研究者首先创建两个极端表型的混合群体，一个是具有目标性状的群体（如抗病性强），另一个是不具有目标性状的群体（如抗病性弱）。然后，对这两个混合群体的基因组进行测序，并比较它们之间的遗传差异，从而定位与目标性状相关的基因或基因区段。 BSA-seq的优势在于其快速、高效地定位影响性状的基因的能力，这在传统的QTL（Quantitative Trait Locus）定位研究中通常需要大量的工作和时间。此外，BSA-seq的高通量测序数据还可以提供更全面的基因组变异信息，有助于深入理解性状的遗传基础。