RIP-seq（RNA Immunoprecipitation followed by Sequencing）是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的高通量测序技术。这种方法特别适用于研究RNA结合蛋白（RBPs）如何与RNA分子结合，从而影响RNA的稳定性和功能，如剪接、转运、翻译和降解等。 RIP-seq的核心原理是利用特异性抗体捕获目标RNA结合蛋白，与其结合的RNA分子随之被共沉淀下来。通过对沉淀的RNA进行测序，研究者可以确定哪些RNA分子与特定的RNA结合蛋白相互作用。 RIP-seq的应用领域包括： 1、RNA剪接研究：研究RNA结合蛋白在RNA剪接过程中的作用。 2、RNA稳定性和转运研究：研究RNA结合蛋白如何影响RNA的稳定性和细胞内转运。 3、RNA翻译调控研究：研究RNA结合蛋白在翻译调控中的作用。 4、疾病相关研究：研究RNA结合蛋白在疾病发生和发展中的作用。 RIP-seq为研究RNA与蛋白质相互作用的复杂性和多样性提供了有力的工具，对于理解RNA代谢和调控网络具有重要的意义。