ChIP-seq（Chromatin Immunoprecipitation followed by Sequencing）是一种结合了染色质免疫沉淀（ChIP）技术和高通量测序的实验方法，用于研究蛋白质与DNA的相互作用。这种方法可以用来鉴定转录因子、组蛋白修饰或其他与DNA结合的蛋白质的结合位点。 ChIP-seq的核心原理是利用特异性抗体捕获目标蛋白质，与其结合的DNA片段随之被沉淀下来。通过高通量测序，研究者可以确定这些DNA片段的序列，从而揭示蛋白质在基因组上的结合位点。 ChIP-seq的应用领域包括： 1、转录因子研究：鉴定转录因子在基因组上的结合位点，研究转录调控网络。 2、组蛋白修饰分析：研究组蛋白修饰在基因表达调控中的作用。 3、表观遗传学研究：研究染色质结构和表观遗传标记在基因表达调控中的作用。 4、疾病研究：研究特定疾病相关的蛋白质-DNA相互作用，揭示疾病发生的分子机制。 ChIP-seq为理解蛋白质-DNA相互作用的复杂性和多样性提供了深刻的见解，并在生物学和医学研究中有着广泛的应用。